Le musée conserve des collections très diverses à caractère anthropologique qui ont comme point commun l’évocation de l’histoire de l’archipel. Elles sont constituées de :
- Collection ethnologique (liée à l’activité maritime et la vie quotidienne)
- Collections sciences naturelles :
- Ornithologie,
- Ichtyologie,
- Entomologie,
- Botanique,
- Géologie.
- Collection Numismatique,
- Collection Philatélique,
- Collection Archéologique,
- Collection Iconographique,
- Collection Beaux Arts.
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